Việc khai thác đá vôi gây ra các tác động tiêu cực đến môi trường như ô nhiễm không khí (bụi, khí độc, tiếng ồn), ô nhiễm nước (từ nước mưa chảy tràn, chất thải), suy giảm đa dạng sinh học và mất cảnh quan tự nhiên.
Để sử dụng đá vôi hiệu quả và bền vững, cần áp dụng các biện pháp như khai thác hợp lý, tái sử dụng và cải tiến quy trình sản xuất để giảm thiểu chất thải, đồng thời khai thác các nguồn tài nguyên thay thế khi có thể.