Trong cơ thể kiến ba khoang có chứa độc tố Pederin, độc tính mạnh gấp 12 - 15 lần nọc của rắn hổ nhưng do lượng tiếp xúc nhỏ và chỉ ở ngoài da nên không đủ gây chết người như nọc rắn. Bị kiến ba khoang cắn, chất độc Pederin có thể gây rộp, phỏng da, viêm da ở nhiều mức độ từ nhẹ đến nặng.
Những triệu chứng thường gặp khi bị kiến ba khoang đốt: Sau khi bị đốt bạn sẽ cảm thấy rát bỏng tại chỗ, nếu tổn thương trên diện rộng có thể sốt, đau dây thần kinh, đau khớp, nôn ói. Xuất hiện viêm da ở vùng hở như mặt, cổ, ngực, vai, gáy, tay. Viêm da dạng vệt hồng ban dài, có mụn mủ.