Ưu điểm:
- Rút ngắn thời gian tạo giống
- Mở ra nhiều ứng dụng trong trồng trọt chăn nuôi như tạo giống biến đổi gen ở trồng trọt, tạo cây có khả năng chống sâu bệnh hại, chống vi rút, thuốc trừ sâu diệt cỏ,...
- Tạo được giống mới có năng suất cao, phẩm chất tốt, cung cấp sản phẩm cho con, gia tăng hiệu quả kinh tế
Nhược điểm :
- Tạo ra nhưng sinh vật biến đổi gen có thể kháng thuốc,khi bị bệnh thì không chữa được, ảnh hưởng sức khỏe con người: dị ứng, nguy cơ tiềm ẩn
- Nếu quá trình CLTN chỉ giữ lại những biến dị có lợi cho tiến hóa thì công nghệ gen chỉ cho cây trồng giữ lại những tính trạng đã được định hướng trước theo nhu cầu người sử dụng, không đóng góp cho quá trình tiến hóa vì tính bấp bênh của nó
