Menđen đã sử dụng phương pháp phân tích các thế hệ lai trong nghiên cứu của mình để đưa ra các qui luật di truyền. Nội dung là:
-Chọn ra những dòng thuần chủng.
-Lai các cặp bố mẹ thuần chủng khác nhau về 1 hoặc 1 số cặp tính trạng tương phản rồi theo dõi sự di truyền riêng rẽ của từng cặp tính trạng đó trên con cháu của từng cặp bố mẹ.
-Dùng toán thống kê để phân tích số liệu thu được. Từ đó rút ra qui luật di truyền các tính trạng của bố mẹ cho các thế hệ con cháu.