Cơ chế di truyền học của hiện tượng lặp đoạn NST là do
NST tái sinh không bình thường ở một số đoạn. sự đứt gãy trong quá trình phân li của của các NST đơn về các tế bào con. trao đổi chéo không đều giữa các crômatit ở kì đầu của giảm phân I. tác nhân đột biến làm đứt rời NST thành từng đoạn và nối lại ngẫu nhiên.