Cồn giết chết các vi sinh vật bằng cách biến tính Protein của chúng và hòa tan lipid của chúng. Bản chất của tế bào là protein, protein lại cấu tạo từ các acid amin, các acid amin lại có các liên kết hydro giữa nhóm -NH2 và -COOH trong phân tử. Mà cồn lại là C2H5-OH, có liên kết H trong nhóm -OH, các liên kết H yếu sẽ hòa tan với nhau, làm cho tế bào của vi khuẩn bị phá hủy. Dùng cồn 70 độ vì nồng độ của nó là phù hợp nhất. Cồn 50 độ là chất dễ cháy, dễ bắt lửa, nên rất nguy hiểm. Cồn 90 độ lại qua đậm đặc, thoa vào vết thương gây rát, làm đông thành tế bào của vi khuẩn khiến chsng có lớp màng bảo vệ, phản tác dụng. Nói tóm lại, dùng cồn 70 độ sát khuẩn là phù hợp nhất
