Cây phát sinh giới động vật cho biết mức độ quan hệ họ hàng của các nhóm động vật. Nhóm có vị trí gần nhau cùng nguồn gốc có họ hàng gần hơn nhóm ở xa.
VD : - Chân khớp có quan hệ gần với Thâm mềm hơn.
- Thân mềm có quan hệ gần với ngành Giun đốt hơn.
- Chim và thú gần với Bò sát hơn các loài khác.