Tiêu hóa nội bào là tiêu hóa thức ăn ở bên trong tế bào. Thức ăn được tiêu hóa hóa học trong không bào tiêu hóa nhờ hệ thống enzim.
Mà động vật nguyên sinh và bọt biển là những động vật đơn bào xuất hiện sớm nhất thuộc giới nguyên sinh vật( Protista) gồm các nhân chuẩn đơn bào ( trùng roi, trùng đế giày, trùng biến hình,...) những động vật này thì chưa có cơ qua tiêu hóa chủ yếu tiêu hóa trong không bào tiêu hóa.( định nghĩa của tiêu hóa nội bào)
Còn ở động vật bậc cao thì do đã tiến hóa cấp cao thành túi tiêu hóa, ống tiêu hóa và được phân hóa thành các cơ quan chuyên hóa để tiêu hóa thức ăn ( tiêu hóa ngoại bào).