Đáp án D
Nội dung A sai, giao phối không ngẫu nhiên không làm thay đổi tần số alen của quần thể.
Nội dung B sai. Giao phối không ngẫu nhiên, chọn lọc tự nhiên không làm thay đổi tần số alen của quần thể.
Nội dung C sai. Chọn lọc tự nhiên không làm phát sinh những biến dị mới trong quần thể.
Nội dung D đúng. Cả 3 nhân tố tiến hóa trên đều làm thay đổi tần số kiểu gen của quần thể.