Nguyên nhân chính dẫn tới lúa đạt năng suất thấp là do ảnh hưởng mưa bão, triều cường làm cho nhiều diện tích lúa bị đổ ngã, ngập úng
Năng suất lúa giảm do tình hình thời tiết vụ đông xuân khắc nghiệt, rét đậm, rét hại kéo dài đúng vào giai đoạn mạ và đẻ nhánh dẫn tới lúa sinh trưởng kém, trỗ chậm hơn so với hằng năm. Nhiệt độ thấp, độ ẩm không khí lớn, số giờ nắng trong ngày thấp đã làm hạn chế quá trình hấp thu dinh dưỡng, quang hợp và đẻ nhánh của cây lúa, ngừng quá trình thải độc trong đất, dẫn tới lúa sinh trưởng, phát triển chậm, đẻ nhánh ít và muộn hơn so với cùng kỳ hằng năm cho nên nhiều diện tích bị chết hoặc nghẹt rễ, vàng lá.
Năng suất lúa giảm do đổ ngã, ngập úng, xâm nhập mặn
Có nhiều nguyên nhân khiến năng suất lúa giảm
+ Do Thời tiết thay đổi, thiên tai, không phù hợp để lúa phát triển
+ Do Các loại sâu bệnh, chuột ăn lúa gây hại khiển lúa bị chết
+ Do chế độ trồng, chăm sóc lúa chưa thực sự được sát sao, lạm dụng thuốc trừ sâu, thuốc bảo vệ thức vật
+ Do giống lúa không tốt, lúa giống lấy từ đời trước
+ Do diện tích đất nông nghiệp bị thu hẹp
- Do các côn trùng gây hại: sâu bọ, rầy nâu...
- Do điều kiện môi trường không thích hợp: nhiệt độ quá cao kéo dài gây cháy lúa, thiếu nước...; nước ngập sau những trận mưa kéo dài gây úng lúa...
Ngoài ra còn do dư lượng thuốc trừ sâu, thiếu phân bón,...