Ngọc trai là một vật cứng hình cầu, được hình thành bên trong thân loài nhuyễn thể như trai, sò, ốc…
Quá trình hình thành ngọc trai có thể tóm tắt ngắn gọn như sau: Khi lọt vào cơ thể con trai, sò, ốc…, các dị vật ma sát với cơ thể con vật tạo ra thương tổn. Theo bản năng, các sinh vật sống sẽ phản xạ để tự chữa lành vết thương, bằng cách tiết ra chất Canxi Cacbonat (CaCO3) bao bọc dị vật. Chất này được dính với nhau bởi một hợp chất hữu cơ giống chất sừng gọi là Conchiolin.
Sự kết hợp giữa Canxi Cacbonat và Conchiolin được gọi là Xà cừ. Canxi Cacbonat chiếm hơn 90%, phần còn lại là nước và các hợp chất hữu cơ tạo ra sự sống cho viên ngọc. Cấu trúc lớp xà cừ tạo bởi hàng nghìn lớp tinh thể Canxi Cacbonat mỏng với độ dày khoảng 0.3 mm. Cấu trúc này có ảnh hưởng tới màu sắc, độ ánh, tính bền vững và đàn hồi của ngọc trai.
Lớp ngoài cùng của ngọc trai có sự gắn kết chặt chẽ giữa các nguyên tố kim loại như magie, nhôm, ion, đồng, bạch kim… Tất cả những yếu tố đó sẽ cho ra đời những viên ngọc trai lung linh sắc màu.
.