Nguyên nhân làm cho tốc độ truyền tin qua xináp hóa học bị chậm hơn so với xináp điện là:
Diện tiếp xúc giữa các nơron khá lớn nên dòng điện bị phân tán. Cần có thời gian để phá vỡ túi chứa và để chất môi giới khuếch tán qua khe xináp. Cần đủ thời gian cho sự tổng hợp chất môi giới hoá học. Phải có đủ thời gian để phân huỷ chất môi giới hoá học