Một số loại phân bón vi sinh được sử dụng phổ biến hiện nay:
- Phân vi sinh cố định đạm (N).
- Phân vi sinh phân giải lân.
- Phân vi sinh phân giải cellulose.
- Phân bón vi sinh phân giải silicat.
- Phân bón vi sinh ức chế các vi sinh vật gây bệnh.
- Phân bón vi sinh giữ ẩm cho đất.