Trong quá trình hô hấp cây cũng lấy oxi và thải cacbonic như người và động vật. Cây lấy khí ôxi để phân giải các chất hữu cơ tạo ra năng lượng cung cấp cho hoạt động sống của cây, đồng thời thải ra khí cacbonic và hơi nước.Cây hô hấp suốt ngày đêm (khi không có ánh sáng).Mọi cơ quan của cây(hoa,lá,rễ,quả,hạt) đều tham gia hô hấp và trao đổi khí trực tiếp với môi trường bên ngoài.