Đối với những loài khác xa nhau có thể căn cứ vào những điểm sai khác bên ngoài của chúng để phân biệt dễ dàng. Nhưng để phân biệt 2 loài thân thuộc, rất giống nhau thì phải dựa vào một số tiêu chuẩn. Tiêu chuẩn hình thái Các cá thể cùng loài có chung một hệ tính trạng hình thái giống nhau; giữa chúng có thể có những khác biệt nhỏ ở tính trạng này hay tính trạng khác, với những dạng trung gian chuyển tiếp.
+ Với 3 loại thân chính là: thân đứng, thân leo và thân bò thì căn cứ vào vị trí của thân trên mặt đất để phân chia
- Thân đứng: những cây có thân tự đứng được trên mặt đất
- Thân leo: những cây có thân phải bám, leo dựa vào các vật khác như cột, cọc tre, giàn ...
- Thân bò: những cây có thân mềm yếu bò sát mặt đất
+ Với các loại thân biến dạng: em căn cứ vào đặc điểm hình dạng, cấu tạo từng loại để phân chia thành thân củ, thân rễ hay thân mọng nước