Định nghĩa:
Nguyên tử là phần tử nhỏ nhất cấu tạo nên chất. Phân tử là tập hợp bao gồm nhiều nguyên tử cấu tạo nên chất.Sự tồn tại tự do:
Nguyên tử không thể tồn tại tự do. Phân tử có thể tồn tại tự do.Cấu tạo:
Nguyên tử bao gồm hạt nhân (protons và neutrons) và các hạt electron. Phân tử bao gồm các nguyên tử trong cùng 1 nguyên tố hoặc nhiều nguyên tố.Hình dạng:
Nguyên tử có dạng hình cầu. Phân tử có thể là bất kỳ hình dạng nào.Khả năng phân đôi:
Nguyên tử không thể bị phân đôi thêm nữa, nếu cố gắng phân đôi sẽ mất đi đặc tính ban đầu. Phân tử có thể bị phân đôi dễ dàng mà vẫn giữ nguyên đặc tính ban đầu.